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CarloJekko
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Posts: 1315
Location: Baia Domizia :-)
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 Posted: Thu May 05, 2005 2:37 pm Post subject: [ot] matlab 7 e glibc |
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EDIT: la soluzione al problema me lo hanno risolto così:
https://forums.gentoo.org/viewtopic.php?p=2584006#2584006
1)riemergere le glibc 2.3.5-r1 mascherate con le use "glibc-compat20 nptl -nptlonly"
2)eseguire il matlab con LD_ASSUME_KERNEL=2.4.19
infatti come supponevo il glibc-2.3.5 non era stato patchato con le patch del 2.3.4 e quindi il matlab non andava più
ora và una bomba.. anche se il problema dell'opengl non l'ho ancora risolto
EXPOST
Oggi mi sono accorto che il matlab 7 non funziona più
mi dà quest'errore
head: `-1' option is obsolete; use `-n 1' since this will be removed in the future ## questo lo dava anche prima
Inconsistency detected by ld.so: ../sysdeps/generic/dl-tls.c: 75: _dl_next_tls_modid: Assertion `result <= _rtld_local._dl_tls_max_dtv_idx' failed!
potrebbe essere l'aggiornamento che ho fatto al glibc 2.3.5 ?
_________________
C.
Last edited by CarloJekko on Tue Jul 19, 2005 2:55 pm; edited 4 times in total |
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randomaze
Bodhisattva
Joined: 21 Oct 2003
Posts: 9985
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| Posted: Thu May 05, 2005 3:25 pm Post subject: Re: [ot] matlab 7 e glibc |
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| CarloJekko wrote: | Oggi mi sono accorto che il matlab 7 non funziona più
mi dà quest'errore
head: `-1' option is obsolete; use `-n 1' since this will be removed in the future ## questo lo dava anche prima
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infatto non é un problema. se vuoi puoi correggere lo script come indicato e rimuoverlo
| Quote: | Inconsistency detected by ld.so: ../sysdeps/generic/dl-tls.c: 75: _dl_next_tls_modid: Assertion `result <= _rtld_local._dl_tls_max_dtv_idx' failed!
potrebbe essere l'aggiornamento che ho fatto al glibc 2.3.5 ? |
beh quello sembra essere un problema in una libreria....
lo strano é che normalmente i programmi proprietari sono linkati staticamente
_________________
Ciao da me! |
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CarloJekko
Veteran
Joined: 31 Mar 2005
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Location: Baia Domizia :-)
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| Posted: Thu May 05, 2005 3:27 pm Post subject: |
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hai perfettamente ragione... sembra strano anche a me
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C. |
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randomaze
Bodhisattva
Joined: 21 Oct 2003
Posts: 9985
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| Posted: Thu May 05, 2005 3:48 pm Post subject: |
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| CarloJekko wrote: | | hai perfettamente ragione... sembra strano anche a me |
Prova con ldd a scoprire le librerie che cerca matlab... oppure manda una mail al loro supporto tecnico
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Ciao da me! |
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CarloJekko
Veteran
Joined: 31 Mar 2005
Posts: 1315
Location: Baia Domizia :-)
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| Posted: Thu May 05, 2005 4:28 pm Post subject: |
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| randomaze wrote: | | oppure manda una mail al loro supporto tecnico |
hmmm.... Forse no 
P.s. meglio se provo con ldd....
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C. |
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fabius
Guru
Joined: 29 Nov 2004
Posts: 525
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| Posted: Thu May 05, 2005 5:41 pm Post subject: |
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Mi pare che matlab abbia problemi con la versione NPTL delle glibc. Spero che tu abbia compilato le glibc con flag -nptlonly: in questo caso prova a lanciarlo con
| Code: | | LD_ASSUME_KERNEL=2.4.1 matlab |
per usare la vecchia thread library. |
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CarloJekko
Veteran
Joined: 31 Mar 2005
Posts: 1315
Location: Baia Domizia :-)
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| Posted: Thu May 05, 2005 5:58 pm Post subject: |
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| Code: | LD_ASSUME_KERNEL=2.4.1 matlab
/bin/sh: error while loading shared libraries: libdl.so.2: cannot open shared object file: No such file or directory
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| Code: | LD_PRELOAD=/lib/libdl.so.2 LD_ASSUME_KERNEL=2.4.1 matlab
ERROR: ld.so: object '/lib/libdl.so.2' from LD_PRELOAD cannot be preloaded: ignored.
/bin/sh: error while loading shared libraries: libdl.so.2: cannot open shared object file: No such file or directory
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mie use
| Code: | USE="cups slp opengl arts avi cdparanoia cdrom divx4linux dvd dvdr \
dvdread dxr3 ffmpeg real gimp gimpprint mmx mmx2 mp3 mpeg mpeg4 \
mplayer nvidia avi dv esd sblive fbcon java gphoto2 hal javascript \
kde xv quicktime sse sse2 v4l v4l2 X xine xvid win32codecs joystick \
ogg font-server nptl nptlonly codecs -pam \
mozdevelop moznoxft mozsvg mozxmlterm"
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C. |
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fabius
Guru
Joined: 29 Nov 2004
Posts: 525
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| Posted: Thu May 05, 2005 6:06 pm Post subject: |
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Prova a dare un
| Code: | | eu-readelf -n /lib/libc-${LIBC_VERSION}.so |
dove LIBC_VERSION dipende da quale hai installato. Io ottengo ad esempio
| Code: | Note segment of 32 bytes at offset 0x00000174:
Owner Data size Type
GNU 16 VERSION
OS: Linux, ABI: 2.4.1 |
Ora metti in LD_ASSUME_KERNEL il numero vicino ad ABI |
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GhePeU
Guru
Joined: 12 Aug 2003
Posts: 549
Location: Mestre, Italy
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| Posted: Thu May 05, 2005 6:26 pm Post subject: |
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è stupido usare nptlonly se si ha software proprietario nel sistema
a me matlab 7 funziona sia con glibc 2.3.5 nptl che con glibc 2.3.5 linuxthreads, però diversi toolbox su nptl non vanno
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That is not dead which can eternal lie,
and with strange aeons even death may die. |
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CarloJekko
Veteran
Joined: 31 Mar 2005
Posts: 1315
Location: Baia Domizia :-)
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| Posted: Fri May 06, 2005 1:07 pm Post subject: |
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| Code: | PenguinianRemake root # eu-readelf -n /lib/libc-2.3.5.so
Note segment of 32 bytes at offset 0x00000194:
Owner Data size Type
GNU 16 VERSION
OS: Linux, ABI: 2.6.6
PenguinianRemake root # LD_ASSUME_KERNEL=2.6.6 matlab
head: `-1' option is obsolete; use `-n 1' since this will be removed in the future
Inconsistency detected by ld.so: ../sysdeps/generic/dl-tls.c: 75: _dl_next_tls_modid: Assertion `result <= _rtld_local._dl_tls_max_dtv_idx' failed!
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Ma con il 2.3.4-2005 funzionava con nptl e nptl-only
Dovrei ricompilare il glibc senza queste due use?
Ma poi il sistema perde il 33% più o meno della velocità
@Ghepeu
mi dici quali toolbox non funzionano con nptl?
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C. |
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CarloJekko
Veteran
Joined: 31 Mar 2005
Posts: 1315
Location: Baia Domizia :-)
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| Posted: Tue May 17, 2005 3:43 pm Post subject: |
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Ho da poco ricompilato il glibc con le sole librerie nptl
Il matalab funziona ma con il comando LD_ASSUME
Googlando un pò e facendo una ricerca ho trovato un post di uno che aveva il mio stesso problema https://forums.gentoo.org/viewtopic-t-288348-highlight-matlab+glibc+nptl.html
Pare che il problema sia dei driver NVIDIA
lui risolve facendo opengl-update xorg-x11
io installando i driver nvdia con il suffisso --force-tls=classic
Domanda : volendo rimanere con l'installazione di gentoo che è moooolto più comoda mi conviane fare opengl-update xorg-x11 e quando ho finito di lavorare opengl-update nvidia ? torna tutto come prima ? Pure l'accelerazione 3d ? Grazie cmq a tutti
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C. |
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CarloJekko
Veteran
Joined: 31 Mar 2005
Posts: 1315
Location: Baia Domizia :-)
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| Posted: Tue Jun 14, 2005 12:38 pm Post subject: |
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riesumo questo post....
Allora ho visto che il matlab R14 non è ufficialmente compatibile con il kernel 2.6.x
http://www.mathworks.com/support/sysreq/release14/unix.html
questi i requisiti
Linux - built using Kernel 2.4.x and glibc (glibc6) 2.2.5
Io Kernel Linux 2.6.11-gentoo-r9 e glibc (glibc6) 2.3.5
E molte cose come il symbolic (necessario per le eq differenziali) non mi fungono
solo Matlab R14 Sp2 supporta
Linux Kernel 2.6.x and glibc (glibc6) 2.3.2 ( http://www.mathworks.com/support/sysreq/current_release/unix.html )
visto che non ho la possibilità di installare l'sp2, la domanda è questa:
Posso avere due kernel differenti (sono sicuro di sì ma non sò come fare)
Questa è più difficile : Posso avere due glibc differenti ?
Grazie in anticipo...
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C. |
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Onip
Advocate
Joined: 02 Sep 2004
Posts: 2912
Location: Parma (Italy)
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| Posted: Tue Jun 14, 2005 3:10 pm Post subject: |
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c'è una FAQ di fedeli per quello, mi ricordo di averne visto il titolo
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Linux Registered User n. 373835
Titus Lucretius Carus, De Rerum Natura - Tantum religio potuit suadere malorum |
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CarloJekko
Veteran
Joined: 31 Mar 2005
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Location: Baia Domizia :-)
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| Posted: Tue Jun 14, 2005 9:28 pm Post subject: |
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quella di fedeli è di avere 2 kernel... e di metterli nel file di grub.. ma questo lo sò...
il prob mio è di mettere due kernel di cui unoi deve essere 2.4.28 ke sappia usare le glibc nptl ma non nptlonly... o di avere due glibc
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C. |
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GhePeU
Guru
Joined: 12 Aug 2003
Posts: 549
Location: Mestre, Italy
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| Posted: Tue Jun 14, 2005 11:04 pm Post subject: |
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matlab r14 (compreso il symbolic) funziona senza problemi su kernel 2.6 e glibc 2.3.5, lo uso da mesi
l'unica cosa che serve è avere le glibc compilate SENZA nptlonly, in modo da avviarlo con LD_ASSUME_KERNEL=2.4.1
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CarloJekko
Veteran
Joined: 31 Mar 2005
Posts: 1315
Location: Baia Domizia :-)
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| Posted: Wed Jun 15, 2005 8:33 am Post subject: |
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fai questa operazione.. a me dà un errore nel libc6 (con ld_assume)
| Code: | a=sym(1)/sym(2)
b=sym(1)/sym(3)
a+b |
Così proviamo se è veramente il miomatlab..
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C. |
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CarloJekko
Veteran
Joined: 31 Mar 2005
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Location: Baia Domizia :-)
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| Posted: Sat Jun 25, 2005 8:58 pm Post subject: |
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Riesumo per l'ennesima volta questo post... SCUSATE SE VI ROMPO DI NUOVO!
allora, a scanso di equivoci ho messo il matlab r14 sp2 che funziona perfettamente con il mandrake di un mio amico con ld_assume_kernel=2.4.1 con kerne 2.6.8.
A me, quando carico il symbolic, mi restituisce
| Code: | ??? Invalid MEX-file '/home/matlab/toolbox/symbolic/maplemex.mexglx': /home/matlab/bin/glnx86/libmaple.so: symbol errno, version GLIBC_2.0 not defined in file libc.so.6 with link time reference.
Error in ==> maple at 104
[result,status] = maplemex(statement);
Error in ==> sym.sym at 107
maple([x ':=''' x '''']); |
Che può essere ?
| Code: | PenguinRemake carlo # eu-readelf -n /lib/libc-2.3.5.so
Note segment of 32 bytes at offset 0x194:
Owner Data size Type
GNU 16 VERSION
OS: Linux, ABI: 2.4.1
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| Code: | PenguinRemake carlo # emerge -pv glibc
These are the packages that I would merge, in order:
Calculating dependencies ...done!
[ebuild R ] sys-libs/glibc-2.3.5 -build -debug -erandom -hardened (-multilib) +nls -nomalloccheck +nptl -nptlonly -pic +userlocales 0 kB
Total size of downloads: 0 kB
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E' possibile che debba ricompilare qualcosa?
EDIT
sul sito ho trovato questo | Code: | | obtain a version of the C library that contains support for the version 2.0 symbols -- glibc-2.2.5 supports these symbols. Place this version of the library into $MATLAB/sys/os/glnx86 for MATLAB's use, where $MATLAB is the root MATLAB directory. |
come faccio a compilare il glibc-2.2.5 e metterlo qui $MATLAB/sys/os/glnx86 ? senza però toccare il glibc che già ho?
facendo
| Code: | | emerge -B glibc-2.2.5.ebuild |
? GRAZIE
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C. |
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CarloJekko
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| Posted: Sun Jun 26, 2005 9:53 pm Post subject: |
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Anche emergendo quel pacchetto e mettendolo in /os/glx86 mi dà un secondo errore con sed (credo che sed awk e grep non supportino quelle librerie)
Che casino ho da fare un'esame  ... la soluzione che ho trovato è la + triviale ma è la + veloce e sopratutto è l'unica
installo un secondo gentoo su una parrtizione scema di 200 Mb e metto solo il glibc il gcc il kernel e l'x11 
_________________
C. |
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CarloJekko
Veteran
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| Posted: Wed Jul 06, 2005 5:49 pm Post subject: |
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Riesumo questo post per la 150.000 volta... (appena faccio quest'esame vado dalla mathworks e gli lancio i loro cd appresso  )
Allora.. dopo aver installato una "nuova gentoo super minimale" tutto filava liscio come l'olio... era stupenda matlab fungeva al 101% (andava anche l'openGL che sul winzozz di un mio collega con una cpu di 400 Mhz in più e con tecnologia HT, andava a scatti.. come godevo  )
Però, con la mia testa fracica, mi sono messo a "sbariare" e ricompilare il glibc... solo che alla fine una einfo che ho appena fatto in tempo a leggere mi diceva che il glibc lo dovevo compilare con -Wl ed altre cose che non ho fatto in tempo a segnarmi... conclusione il matlab mi dà gli stessi errori della Super-Gentoo originale... Come faccio a prendere questa einfo? nel suo ebuild non c'è... Cmq se non si risolve reinstallo tutto... tanto con lo stage3 e la funzione super-minimale impiego 2 ore ad installarlo... solo che se riesco a risolvere senza è meglio... Grazie a tutti...
_________________
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CarloJekko
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| Posted: Tue Jul 19, 2005 2:56 pm Post subject: |
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up soluzione... vedi 1° post
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